南京审计大学应用数学系建立于2003年，同年开始招收数学与应用数学专业本科生，现设有数学与应用数学和金融数学两个本科专业。自2009年起，数学学科作为校博士点和硕士点建设的支撑学科。2014年获批省金融工程重点实验室并于2020年通过验收。数学学科为“十二五”校重点建设学科和“十三五”省重点建设学科。学科团队成员24人，其中高级职称占比67%，拥有省级高层次人才16人次。

  近五年来，数学学科建设取得了一些标志性的成果。专业建设和人才培养方面，数学与应用数学专业获批江苏省一流本科专业建设点，并被推荐申报2021年国家级一流本科专业建设点；《数学分析一》获批江苏省一流本科课程，并被推荐国家级一流本科课程遴选；1人获省教学成果二等奖，1人获省级教学竞赛二等奖，1人获省级微课比赛二等奖，出版教材2部；学生在各类竞赛中获奖100余项，含全国大学生数学建模竞赛一等奖2项、二等奖4项，学生获批省级大学生创新创业项目10余项。科学研究方面,在分形理论、组合数论、应用概率论、高性能算法等领域，有40余篇论文发表于SIAM J. Sci. Comput.，J. Comput. Phys.，J. Sci. Comput.，J. Funct. Anal., Trans. Amer. Math. Soc., J. Theor. Probab.,等权威期刊，其中ESI前1%高被引论文2篇。近5年获32项课题资助，其中省部级以上16项，发表学术论文100余篇。